王琪，字君玉，华阳（今四川成都）人，徙舒（今安徽庐江）。王罕之子，王珪从兄。进士及第，曾任江都主簿。天圣三年（1025）上时务十事，得仁宗嘉许，命试学士院，调入京城任馆阁校勘，授大理评事、馆阁校勘、集贤校理，知制诰。嘉佑中，守平江府，数临东南诸州。任姑苏郡守时，修建官衙，向转运使司借款数千缗，无力偿还，政尚简静。
嘉祐四年（1059年），王琪增订刊刻王洙之《杜工部集》于苏州，并撰写《后记》，在序中对杜甫的“博闻稽古”加以肯定。《杜工部集》一次印一万部，“每部为直千钱，士人争买之，富室或买十许部”。有《谪仙长短句》，已佚。《宋史》附传王珪。今有周泳先辑《谪仙长短句》一辑。《全宋词》录其词十一首。他是著名的豪放派词人。
以礼部侍郎致仕，年七十二卒。墓葬真州（今江苏仪征县）。